bonohulab

bonohu は、Bono at Hiroshima Universityの略称です。 データ駆動型ゲノム育種（デジタル育種）に向けたバイオDXと呼ばれるバイオインフォマティクスを主軸とした遺伝子機能解析技術を開発し、ゲノム編集に応用しています。

• 研究概要に関しては以下のサムネールから辿れる動画をご参照ください
• 民間企業様との共同研究等、歓迎します。広島大学社会・産学連携の技術相談のウェブページをご参照下さい
• bonohulabでの研究活動に対する寄付をお願いしています。ご寄付頂けた場合、税制上の優遇措置があります

ニュース

• 231001 ゲノム編集先端人材育成プログラム（卓越大学院プログラム）の博士課程後期大学院生（社会人）として森原なぎささんが入学され、bonohulabに加わりました
• 231001 坊農が教授（承継教授）に採用されました
• 230926 研究員の栂さんらによる、東京農工大学大学院 農学研究院生物生産科学部門 動物生化学（昆虫系）研究室との共同研究論文 Long-read genome assembly of the Japanese parasitic wasp Copidosoma floridanum (Hymenoptera: Encyrtidae) (DOI: 10.1101/2023.09.24.559078) が bioRxiv に公開されました
• 230925 共同研究講座助教の中前さんと坊農による研究論文 DANGER analysis: risk-averse on/off-target assessment for CRISPR editing without a reference genome　(DOI: 10.1093/bioadv/vbad114) を「ゲノム編集のための簡易的安全性評価ソフトウェアを新規開発〜バイオDXによる安全な品種改良やゲノム医療へ期待〜」と題してプレスリリースしました
• 230919 研究室のメンバーほぼ全員の総勢14名で国内版バイオハッカソン BH23.9に参加します
• 230906 坊農が編集した改訂版RNA-Seqデータ解析　WETラボのための超鉄板レシピ　ヒトから非モデル生物まで　公共データの活用も充実が出版されました。坊農のほか、博士課程後期大学院生の鈴木さん、研究員の野津さんと栂さん、特任助教の田村さん、OGの小野さんが執筆されました。

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研究内容

主に以下の研究テーマに取り組んでおります。より詳細な研究内容を見る

1. バイオDX基盤技術開発
   1. オミックスデータ測定・解析技術の開発
   2. ゲノム編集データ解析手法とその統合化ワークフローの開発
   3. 有用物質生産パスウェイデザインシステムの開発
2. バイオインフォマティクスによる遺伝子機能解析
   1. 公共データベースからのメタ解析
   2. デジタル育種に向けた比較ゲノム解析
3. 生命科学分野のデータベース構築とその利用技術開発
   1. 公共データベース利用技術の開発
   2. FANTOM国際共同研究におけるデータベース開発

メンバー

個別の研究業績は広大研究者総覧やResearchMapへのリンクをご覧ください。

• 教授・Principle Investigator(PI)
  • 坊農 秀雅 Hidemasa Bono, Ph.D 【広大研究者総覧】
• 特任助教（ゲノム編集イノベーションセンター）
  • 田村 啓太 Keita Tamura, Ph.D 【ResearchMap】
• 研究員
  • 栂 浩平 Kouhei Toga, Ph.D 【ResearchMap】
  • 野津 了 Ryo Nozu, Ph.D 【ResearchMap】
• 博士課程後期生
  • D3 奥原 啓輔 Keisuke Okuhara（社会人大学院生）
  • D2 浅野 さとみ Satomi Asano（社会人大学院生 / 長期履修生）
  • D1 鈴木 貴之 Takayuki Suzuki
  • D1 大豆田 亮 Ryo Mameda（社会人大学院生）
  • D1 森原 なぎさ Nagisa Morihara（社会人大学院生）
• 博士課程前期生
  • M2 新谷 光雄 Mitsuo Shintani
  • M2 米澤 奏良 Sora Yonezawa
  • M1 烏野 素生 Motoki Uno
  • M1 弓矢 誠 Makoto Yumiya
• 修了生
  • 小野 擁子 Yoko Ono, Ph.D (社会人大学院生 / 20.10-22.9)

ゲノム編集イノベーションセンター PtBio共同研究講座 バイオDX研究室

• 共同研究講座助教
  • 中前 和恭 Kazuki Nakamae, Ph.D 【ResearchMap】
• 共同研究員
  • 伊出 佐耶 Saya Ide
  • 大貫 永輝 Nagaki Ohnuki
  • 神田 美幸 Miyuki Kanda, Ph.D
  • 竹本 美沙子 Misako Takemoto, Ph.D

所属

• 広島大学 理学部 生物科学科
• 広島大学 大学院統合生命科学研究科
  • 生命医科学プログラム
  • 数理生命科学プログラム
• 広島大学 ゲノム編集先端人材育成プログラム(卓越大学院プログラム)
• 広島大学 ゲノム編集イノベーションセンター

2023年10月配属の学部学生、2024年4月入学の博士課程前期大学院生を募集しています。希望者はご連絡ください。 より詳細な募集の内容を見る

教育

本務のゲノム編集先端人材育成プログラム（卓越大学院）でのバイオインフォマティクス教育を中心に、統合生命科学研究科の大学院教育ならびに理学部生物科学科の学部教育を担当しております。 より詳細な教育の内容を見る

業績

2021年度に坊農が発表にかかわったSCI論文は12本、 2022年にbonohulabが中心となって発表した査読ずみ論文は9本でした。 より詳細な業績の内容を見る

アクセス

広島大学東広島キャンパスから約2kmほど離れた広島中央サイエンスパーク内の広島大学イノベーションプラザに研究室があります。 より詳細なアクセス情報を見る