bonohulab
bonohu は、Bono at Hiroshima Universityの略称です。 データ駆動型ゲノム育種（デジタル育種）に向けて、バイオDXと呼ばれるバイオインフォマティクスを駆使した遺伝子機能解析を中心に、ゲノム編集に必須のデータ解析基盤技術を開発しています。
- 研究概要に関しては以下をご参照ください
- 民間企業との共同研究等の相談は、広島大学社会・産学連携の技術相談のウェブページをご参照ください
ニュース
- 220926 博士課程前期大学院生の鈴木さんと坊農による研究論文 GEM: Genome Editing Meta-database (DOI:
10.37044/osf.io/wd3bu) が BioHackrXiv に公開されました - 220923 研究員の栂さんと農業・食品産業技術総合研究機構（農研機構） 生物機能利用研究部門の横井さん、坊農による研究論文 Meta-Analysis of Transcriptomes in Insects Showing Density-Dependent Polyphenism (DOI:
10.3390/insects13100864) が Insects に公開されました - 220920 博士課程後期大学院生の小野さんが博士（理学）を取得されました！
- 220917 国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室、広島県農業技術センターと三島食品株式会社との共同研究論文 A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated in Japan (DOI:
10.1101/2022.09.16.508052) が bioRxiv に公開されました - 220913 第39回日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会にて、研究員の田村さんが「ナノポアシークエンサー MinION による吉野川由来スジアオノリのゲノムシークエンシング」と題した口頭発表を行いました
- 220912 農業・食品産業技術総合研究機構（農研機構） 生物機能利用研究部門の横井さん、研究員の若宮さん（当時）と坊農による研究論文 Meta-analysis of the public RNA-Seq data of the Western honeybee Apis mellifera to construct reference transcriptome data (DOI:
10.1101/2022.09.07.506879) が bioRxiv に公開されました - 220909 研究員の田村さんと坊農による研究論文 Meta-analysis of RNA Sequencing Data of Arabidopsis and Rice under Hypoxia (DOI:
10.3390/life12071079) が大学の英語版ウェブサイトにNewly identified genes may help protect crops against flooding, researchers sayと題した記事として紹介されました - 220909 広島大学大学院統合生命科学研究科免疫生物学研究室との共同研究論文 Prediction of sex-determination mechanisms in avian primordial germ cells using RNA-seq analysis (DOI:
10.1038/s41598-022-17726-7) が大学の英語版ウェブサイトにResearcher team investigates sex-determination mechanisms in birds と題した記事として紹介されました
研究内容
主に以下の研究テーマに取り組んでおります。より詳細な研究内容を見る
- ゲノム編集データ解析基盤技術開発
- 有用物質生産パスウェイデザインシステムの開発
- ゲノム編集データ解析のための統合化ワークフローの開発
- バイオインフォマティクスによる遺伝子機能解析
- 公共データベースからの発現変動遺伝子のメタ解析
- ゲノム育種に向けたミツバチ属の比較ゲノム解析
- がん化・老化耐性解明のための新しいモデル動物ハダカデバネズミのゲノムとトランスクリプトーム解析
- 生命科学分野のデータベース構築とその利用技術開発
- 公共遺伝子発現データベース利用技術の開発
- FANTOM国際共同研究におけるデータベース開発
メンバー
個別の研究業績は広大研究者総覧とResearchMapへのリンクをご覧ください。
- 特任教授・Principle Investigator(PI)
- 研究員（共創の場形成支援プログラム+プラチナバイオ共同研究講座）
- 田村 啓太 Keita Tamura, Ph.D 【ResearchMap】
- 栂 浩平 Kouhei Toga, Ph.D 【ResearchMap】
- ゲノム編集イノベーションセンター バイオDX研究室（プラチナバイオ共同研究講座）
- 共同研究講座助教
- 中前 和恭 Kazuki Nakamae, Ph.D 【ResearchMap】
- 共同研究員
- 伊出 佐耶 Saya Ide
- 神田 美幸 Miyuki Kanda, Ph.D
- 共同研究講座助教
- 統合生命科学研究科 ゲノム情報科学研究室
- 研究員
- 野津 了 Ryo Nozu, Ph.D 【ResearchMap】
- 博士課程後期生
- D2 奥原 啓輔 Keisuke Okuhara（社会人大学院生）
- D1 浅野 さとみ Satomi Asano（社会人大学院生 / 長期履修生）
- 博士課程前期生
- M2 鈴木 貴之 Takayuki Suzuki
- M1 新谷 光雄 Mitsuo Shintani
- M1 米澤 奏良 Sora Yonezawa
- 研究員
- 修了生
- 小野 擁子 Yoko Ono, Ph.D (社会人大学院生 / 20.10-22.9)
所属
2023年4月入学の大学院生は応募者多数のため、すでに募集を〆切っております。 より詳細な募集の内容を見る
教育
本務のゲノム編集先端人材育成プログラム（卓越大学院プログラム）でのバイオインフォマティクス教育を中心に統合生命科学研究科の大学院教育を担当しております。 より詳細な教育の内容を見る
教育・研究業績
2021年度に坊農が発表にかかわったSCI論文は12本、 2021年にbonohulabが中心となって発表した査読ずみ論文は4本でした。 より詳細な教育・研究業績の内容を見る
アクセス
広島大学東広島キャンパスから約2kmほど離れた広島中央サイエンスパーク内の広島大学イノベーションプラザに研究室があります。 より詳細なアクセス情報を見る
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