bonohulab

bonohu は、Bono at Hiroshima Universityの略称です。 データ駆動型ゲノム育種（デジタル育種）に向けて、バイオDXと呼ばれるバイオインフォマティクスを駆使した遺伝子機能解析を中心に、ゲノム編集に必須のデータ解析基盤技術を開発しています。

• 研究概要に関しては以下をご参照ください
  • アウトリーチイベント「ゲノム解読から生物のプログラミング」で披露されたbonohulabの紹介動画
  • 研究解説動画「Bio×Digital Transformation (バイオDX)『データ駆動型ゲノム育種技術の開発』」
  • 羊土社刊の実験医学2021年12月号 みんなのバイオDX〜公共データの海で宝探しをはじめよう（坊農企画）
• 民間企業様との共同研究等、歓迎します。広島大学社会・産学連携の技術相談のウェブページをご参照下さい

ニュース

• 230527 日本ゲノム編集学会第8回大会にて、博士課程前期大学院生の米澤さん、博士課程後期大学院生の鈴木さん、共同研究講座助教の中前さんが研究発表を行います
• 230526 The 33rd International Conference on Arabidopsis Researchにて、博士課程前期大学院生の新谷さん、研究員の田村さんが研究発表を行います
• 230514 とっとりバイオフロンティアセミナー（2023年5月22日ハイブリッド開催）にて博士課程後期大学院生の奥原さんと坊農が「みんなのバイオDXセミナー~社会課題解決に向けたイノベーション創出~」と題して講演を行います
• 230513 PacBio HIFI SEQUENCING EXPERIENCE TOUR ロードショー（2023年5月17,18日開催）にて、研究員の田村さんと坊農が「PacBio HiFiリードによるゲノム配列解読の実際」と題して講演を行います
• 230506 研究員の栂さんと坊農による研究論文 Meta-Analysis of Public RNA Sequencing Data Revealed Potential Key Genes Associated with Reproductive Division of Labor in Social Hymenoptera and Termites (DOI: 10.3390/ijms24098353) が International Journal of Molecular Sciences (IJMS) に公開されました
• 230502 博士課程前期大学院生の米澤さんと坊農による研究論文 Meta-analysis of heat-stressed transcriptomes using the public gene expression database from human and mouse samples (DOI: 10.1101/2023.04.30.537112) が bioRxiv に公開されました

すべてのニュースを見る

研究内容

主に以下の研究テーマに取り組んでおります。より詳細な研究内容を見る

1. バイオDX基盤技術開発
   1. オミックスデータ測定・解析技術の開発
   2. ゲノム編集データ解析のための統合化ワークフローの開発
   3. 有用物質生産パスウェイデザインシステムの開発
2. バイオインフォマティクスによる遺伝子機能解析
   1. 公共データベースからのメタ解析
   2. デジタル育種に向けた比較ゲノム解析
3. 生命科学分野のデータベース構築とその利用技術開発
   1. 公共データベース利用技術の開発
   2. FANTOM国際共同研究におけるデータベース開発

メンバー

個別の研究業績は広大研究者総覧やResearchMapへのリンクをご覧ください。

• 特任教授・Principle Investigator(PI)
  • 坊農 秀雅 Hidemasa Bono, Ph.D 【広大研究者総覧】
• 研究員
  • 田村 啓太 Keita Tamura, Ph.D 【ResearchMap】
  • 栂 浩平 Kouhei Toga, Ph.D 【ResearchMap】
  • 野津 了 Ryo Nozu, Ph.D 【ResearchMap】
• 統合生命科学研究科 ゲノム情報科学研究室
  • 博士課程後期生
    • D3 奥原 啓輔 Keisuke Okuhara（社会人大学院生）
    • D2 浅野 さとみ Satomi Asano（社会人大学院生 / 長期履修生）
    • D1 鈴木 貴之 Takayuki Suzuki
    • D1 大豆田 亮 Ryo Mameda（社会人大学院生）
  • 博士課程前期生
    • M2 新谷 光雄 Mitsuo Shintani
    • M2 米澤 奏良 Sora Yonezawa
    • M1 烏野 素生 Motoki Uno
    • M1 弓矢 誠 Makoto Yumiya
  • 修了生
    • 小野 擁子 Yoko Ono, Ph.D (社会人大学院生 / 20.10-22.9)
• ゲノム編集イノベーションセンター バイオDX研究室（プラチナバイオ共同研究講座）
  • 共同研究講座助教
    • 中前 和恭 Kazuki Nakamae, Ph.D 【ResearchMap】
  • 共同研究員
    • 伊出 佐耶 Saya Ide
    • 大貫 永輝 Nagaki Ohnuki
    • 神田 美幸 Miyuki Kanda, Ph.D
    • 竹本 美沙子 Misako Takemoto, Ph.D

所属

• 広島大学 ゲノム編集イノベーションセンター
• 広島大学 ゲノム編集先端人材育成プログラム(卓越大学院プログラム)
• 広島大学 大学院統合生命科学研究科
  • 生命医科学プログラム
  • 数理生命科学プログラム
• 広島大学 理学部 生物科学科

2024年4月入学の博士課程前期大学院生を募集しています。 より詳細な募集の内容を見る

教育

本務のゲノム編集先端人材育成プログラム（卓越大学院）でのバイオインフォマティクス教育を中心に、統合生命科学研究科の大学院教育ならびに理学部生物科学科の学部教育を担当しております。 より詳細な教育の内容を見る

教育・研究業績

2021年度に坊農が発表にかかわったSCI論文は12本、 2022年にbonohulabが中心となって発表した査読ずみ論文は9本でした。 より詳細な教育・研究業績の内容を見る

アクセス

広島大学東広島キャンパスから約2kmほど離れた広島中央サイエンスパーク内の広島大学イノベーションプラザに研究室があります。 より詳細なアクセス情報を見る