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さまざまな生物のゲノム配列を解読し、データ駆動型ゲノム育種(デジタル育種)に向けたバイオDXと呼ばれるバイオインフォマティクスを主軸とした遺伝子機能解析技術を開発、ゲノム編集に応用する研究をおこなっています。

ニュース

  • 261110 東京農工大学農学部生物生産学科にて、坊農が2026年11月20日に「Quest for Pathways with eXpression (QPX) ― 非モデル生物のデータの海から生命現象のストーリーを読み解く ― 」と題して講演を行います
  • 261102 共同研究講座助教の中前さんと坊農による研究論文 tWhEEL: a transcript-aware workflow for quantifying CRISPR knockout feasibility using transcriptome assembly (DOI: 10.64898/2026.10.27.762389) が bioRxiv に公開されました
  • 261029 広島大学大学院医系科学研究科 消化器・移植外科学と共同研究講座助教の中前さん他による共同研究論文 Single-nucleotide genome editing uncovers the biological impact of rs16944 in the IL1B promoter (DOI: 10.1038/s41598-026-75693-9)が Scientific Reportsに公開されました
  • 261026 第475回CBI学会講演会「AI時代における計算科学者の立ち位置 ~研究・教育・現場はどう変わり、私たちは何を学ぶべきか~」(2026年11月9日オンライン開催)にて、「AIを活用した公共データベースのメタ解析」と題して坊農が講演を行います
  • 261014 理学部生物科学科の生物科学基礎実験IV・卒業研究配属として、鹿屋勇道さん、瀬戸なつみさん、河野美乃梨さんがbonohulabに加わりました
  • 261013 早稲田大学先進理工学研究科にて、坊農が2026年10月15日に「バイオDXによるデータ駆動型生物学」と題して講演を行います
  • 261011 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構) 生物機能利用研究部門の横井さんとその研究グループメンバー、共同研究講座研究員の神田さん、プラチナバイオ株式会社の木村さんと坊農による研究論文 Genome sequence data of Ascogaster reticulata (Hymenoptera: Braconidae) (DOI: 10.64898/2026.10.06.756916) が bioRxiv に公開されました

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研究内容

主に以下の研究テーマに取り組んでおります。より詳細な研究内容を見る

  1. バイオDX基盤技術開発
    1. オミックスデータ測定・解析技術の開発
    2. ゲノム編集データ解析手法とその統合化ワークフローの開発
    3. 有用物質生産パスウェイデザインシステムの開発
  2. バイオインフォマティクスによる遺伝子機能解析
    1. 公共データベースからのメタ解析
    2. デジタル育種に向けた比較ゲノム解析
  3. 生命科学分野のデータベース構築とその利用技術開発
    1. 公共データベース利用技術の開発
    2. FANTOM国際共同研究におけるデータベース開発

メンバー

教授1名、研究員2名、学生15名(学部生6名、博士前期課程5名、博士後期課程4名)、共同研究講座10名の総勢28名のラボです。 より詳細なメンバーを見る

所属

2028年4月入学の博士課程前期大学院生を募集しています。希望者は2027年4月中旬までにご連絡ください。 より詳細な募集の内容を見る

教育

統合生命科学研究科の大学院教育、ゲノム編集先端人材育成プログラム(卓越大学院)でのバイオインフォマティクス教育ならびに理学部生物科学科の学部教育を担当しております。 より詳細な教育の内容を見る

業績

2025年にbonohulabが中心となって発表した査読済み論文は8本でした。 より詳細な業績の内容を見る

アクセス

広島大学東広島キャンパスから約3kmほど離れた広島中央サイエンスパーク内の広島大学イノベーションプラザに研究室があります。 より詳細なアクセス情報を見る

About Me

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広島大学 理学部生物科学科・大学院統合生命科学研究科 ゲノム情報科学研究室 / ゲノム編集イノベーションセンター PtBio共同研究講座 バイオDX研究室

Address:
〒739-0046 広島県東広島市鏡山3丁目10-23
広島大学イノベーションプラザ (地図)
Hiroshima University Innovation Plaza, 3-10-23 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima, 739-0046, Japan