業績
学会・研究会発表
2020年4月にbonohulabが立ち上がってからの構成員による主な教育・研究業績のうち学会・研究会発表をリストしています。 これ以外の業績は、論文発表をご覧ください。
- 2024
- 第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場 マリンメッセ福岡
- 2024年11月27日（1日目）
- 1P-020(1AS-16-05) アカシソの特化代謝産物増産を目指したゲノム解読およびパスウェイ可視化システムの応用, 田村 啓太, 大石 直哉, 野津 了, 坊農 秀雅, 口頭発表＋ポスター発表
- 1P-046 新奇モデル生物のための遺伝子機能アノテーションワークフロー, 坊農秀雅, ポスター発表
- 1P-290 非モデル生物におけるパスウェイ解析環境 “qpx” の開発, 野津 了, 大石 直哉, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 1P-326 公共データベース利活用による新規熱ストレス応答遺伝子解析ワークフローの開発：メタ解析と構造類似性検索の活用, 米澤 奏良, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 1P-931 公共RNA-Seqデータベースを活用したイネの干ばつ・塩ストレス耐性品種と感受性品種の比較トランスクリプトーム解析, 新谷 光雄, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 1P-952(1AS-07-04) UnknomicsとTranscriptomicsによるパーキンソン病関連遺伝子の探索, 鈴木貴之, 坊農秀雅, 口頭発表＋ポスター発表
- 2024年11月28日（2日目）
- 2AS-02-04 ゲノム解析技術の革新とデータ駆動型育種への応用, 竹本（今井） 美沙子, 口頭発表(招待)
- 2P-011(2AS-02-07) 昆虫のde novoゲノムアセンブリに対するBRAKER3による遺伝子予測およびFanflow4Insectsによる機能アノテーション, 栂 浩平, 坊農 秀雅, 口頭発表＋ポスター発表
- 2P-028 ゲノム編集によって生じたラージデリーションを高感度に検出するためのサンガーシーケンス解析ソフトウェアの開発, 中前 和恭, 伊出 佐耶, 大貫 永輝, 中川 佳子, 奥原 啓輔, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 2024年11月29日（3日目）
- 3P-316 ブタ、イノシシ、ニワトリ、セキショクヤケイを対象とした家畜動物とその原種における公共遺伝子発現データのメタ解析と手法の改良, 烏野 素生, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 3P-321 データ駆動型ゲノム育種のためのゲノム編集関連植物育種情報データベース構築とその解析, 弓矢 誠, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 3P-964 ゲノム編集技術を用いたニワトリの品種改良 ～全ゲノム解析によるゲノムワイドな変異の確認およびアレルギー低減卵を生産するニワトリ新品種の作出～, 江﨑 僚, 渡邊 天海, 寺田 拓実, 松崎 芽衣, 坊農 秀雅, 山本 卓, 堀内 浩幸, ポスター発表
- 2024年11月27日（1日目）
- Exploration of Target Genes for Parkinson's disease using Transcriptomics and Unknomics, Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono, Biological Data Science, 2024年11月13日, 通常, 英語, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA
- 日本育種学会第146回講演会
- ゲノム編集の植物育種への応用, 坊農秀雅, 日本育種学会第146回講演会 市民公開シンポジウム, 2024年09月23日, 招待, 日本語, 日本育種学会, 東広島
- 公共データベース統合化によるイネの熱ストレスに関連する新規育種標的遺伝子の同定 .トランスクリプトームデータのメタ解析と構造類似性検索の実行, 米澤奏良, 坊農秀雅, 日本育種学会第146回講演会, 2024年09月19日, 通常, 日本語, 日本育種学会, 東広島、日本
- 塩・干ばつストレス耐性・感受性イネ品種の公共RNA-Seqデータのメタ解析による新規ストレス応答性遺伝子の同定, 新谷光雄, 坊農秀雅, 日本育種学会第146回講演会, 2024年09月19日, 通常, 日本語, 日本育種学会, 東広島、日本
- XXVII International Congress of Entomology (ICE2024), 2024年08月25日〜30日, 京都
- Genome analysis of the pupal parasitoid of the stable fly, Spalangia cameroni (Hymenoptera: Spalangiidae), Hiromitsu Araki, Kouhei Toga, Makito Shindo, Kazunori Matsuo, Hidemasa Bono, 口頭発表（招待）
- Meta-analysis of publicly available RNA sequencing data of queens and workers in social hymenopterans and termites, Kouhei Toga, Hidemasa Bono, 口頭発表（招待）
- Functional annotation for insect transcriptomes, Takeya Kasukawa, Hiroko Tabunoki, Hidemasa Bono, 口頭発表（招待）
- 日本ゲノム編集学会第9回大会, 2024年06月17日〜19日, 大阪
- PtWAVE: ゲノム編集で生じるラージデリーションを検出するための高感度なシーケンス波形分解 ソフトウェア, 伊出 佐耶, 中前 和恭, 大貫 永輝, 中川 佳子, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 複合微生物のゲノム編集を目指したデータ駆動型メタトランスクリプトーム解析手法の開発, 大豆田 亮, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 家畜育種におけるゲノム編集ターゲット遺伝子選定のためのトランスクリプトームデータのメタ解析, 烏野 素生, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 塩・干ばつストレス耐性・感受性イネ品種の公共 RNA-Seq データのメタ解析によるゲノム編集 ターゲットの選定, 新谷 光雄, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 新規ゲノム編集ターゲット遺伝子選定のためのイネの熱ストレス関連トランスクリプトームのメタ 解析, 米澤 奏良, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 公共データベースのメタ解析による飢餓耐性獲得のためのゲノム編集ターゲット遺伝子の選定, 光成 仁, 坊農 秀雅, ポスター発表
- 日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会
- 昆虫のDNA配列データ解析を始めよう, 坊農秀雅, 日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会, 2024年03月28日, 招待, 日本語, 日本昆虫学会, 日本応用動物昆虫学会, 仙台
- 遺伝子機能アノテーションワークフローFanflow4Insects, 坊農秀雅, 日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会, 2024年03月28日, 招待, 日本語, 日本昆虫学会, 日本応用動物昆虫学会, 仙台
- PacBio HiFiリードシーケンスによるキンウワバトビコバチのゲノム解読と機能アノテーション, 栂浩平, 田村啓太, 坊農秀雅, 日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会 合同大会, 2024年03月28日, 招待, 日本語, 日本昆虫学会, 日本応用動物昆虫学会, 仙台
- ロングリードシークエンサーによる植物ゲノム解析とそのデータ駆動型ゲノム育種への応用, 田村啓太, 坊農秀雅, 第65回日本植物生理学会年会, 2024年03月17日, 通常, 日本語, 日本植物生理学会, 神戸
- Uncovering New Insights into Sex Change Mechanisms: A Meta-analysis of Gonadal Transcriptomes in Protogynous Fish Species, Ryo Nozu, Mitsutaka Kadota, Masaru Nakamura, Shigehiro Kuraku, Hidemasa Bono, International Plant & Animal Genome / PAG 31, 2024年01月12日, 通常, 英語, San Diego, CA, USA
- 第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場 マリンメッセ福岡
- 2023
- 第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド
- ヒト、マウス、イネを対象とした公共遺伝子発現データベースを用いた熱ストレス関連遺伝子のメタ解析, 米澤奏良, 坊農秀雅, ポスター発表
- シロイヌナズナ公共RNA-Seqデータのメタ解析による新規のアブシジン酸および非生物的ストレス応答性遺伝子の探索, 新谷光雄, 田村啓太, 坊農秀雅, ポスター発表
- パーキンソン病における酸化ストレスを対象とした研究候補遺伝子探索手法の開発, 鈴木貴之, 坊農秀雅, ポスター発表
- 日本産キンウワバトビコバチのロングリードシーケンスによるゲノムアセンブリの構築, 栂浩平, 坂本卓磨, 神田美幸, 田村啓太, 奥原啓輔, 天竺桂弘子, 坊農秀雅, ポスター発表
- 雌性先熟魚における生殖腺トランスクリプトームのメタ解析, 野津了, 門田満隆, 中村將, 工樂樹洋, 坊農秀雅, 口頭発表＋ポスター発表
- バイオDXを活用した新規低酸素応答遺伝子の探索手法の開発, 小野擁子, 坊農秀雅, 口頭発表
- ゲノム編集の安全性評価ソフトウェアの開発〜安心してゲノム育種に取り組める社会を目指して, 中前和恭, 口頭発表
- PacBio HiFi リードによるアカシソのゲノム配列の解読, 田村啓太, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 望月孝子, 松下修司, 加藤義啓, 石川武, 奥原啓輔, 中村保一, 坊農秀雅, 第40回日本植物バイオテクノロジー学会（千葉）大会, 2023年09月10日, 通常, 日本語, 日本植物バイオテクノロジー学会, 千葉
- バイオDXによるゲノム編集基盤技術開発におけるバイオインフォマティクスの役割, 坊農秀雅, 沖縄ならではのSociety5.0実現に向けて, 2023年08月09日, 招待, 日本語, 健康･医療データサイエンス人材育成委託業務受託コンソーシアム, 沖縄
- 公共RNAシーケンスデータを利用したメタ解析による発現変動遺伝子の特定, 栂浩平, 坊農秀雅, 昆虫DNA研究会第19回研究集会, 2023年07月23日, 招待, 日本語, 昆虫DNA研究会, 大阪
- バイオDXによるゲノム編集技術への応用, 坊農秀雅, 第15回遺伝子組換え実験安全研修会, 2023年07月22日, 招待, 日本語, 遺伝子研究安全管理協議会, オンライン
- The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
- Meta-Analysis of Public RNA Sequencing Data of Multiple Abiotic Stresses in Arabidopsis thaliana Provides New Insights into both ABA-Dependent and ABA-Independent Stress Responsive Genes, Mitsuo Shintani, Keita Tamura; Hidemasa Bono, The 33rd International Conference on Arabidopsis Research, 2023年06月05日, 通常, 英語, Chiba, Japan
- Meta-Analysis of RNA Sequencing Data of Arabidopsis and Rice under Hypoxia, Keita Tamura, HIdemasa Bono, The 33rd International Conference on Arabidopsis Research, 2023年06月05日, 通常, 英語, Chiba, Japan
- 日本ゲノム編集学会 第8回大会
- DANGER Analysis:表現型への影響を評価する新規オフターゲット解析ツール, 中前和恭, 坊農秀雅, 日本ゲノム編集学会 第8回大会, 2023年06月06日, 通常, 日本語, 日本ゲノム編集学会, 東京
- 網羅的なゲノム編集メタデータベース構築とその解析, 鈴木貴之, 坊農秀雅, 日本ゲノム編集学会 第8回大会, 2023年06月06日, 通常, 日本語, 日本ゲノム編集学会, 東京
- 公共遺伝子発現データベースを用いた熱ストレス関連遺伝子のメタ解析, 米澤奏良, 坊農秀雅, 日本ゲノム編集学会 第8回大会, 2023年06月06日, 通常, 日本語, 日本ゲノム編集学会, 東京
- 第67回日本応用動物昆虫学会大会
- 社会性膜翅目およびシロアリの女王および働きアリ(ハチ)におけるRNAシーケンスデータのメタ解析, 栂浩平, 坊農秀雅, 第67回日本応用動物昆虫学会大会, 2023年03月13日, 通常, 日本語, 大阪
- ゲノム編集とバイオDXでミライを拓く, 奥原啓輔, 第67回日本応用動物昆虫学会大会, 2023年03月13日, 招待, 日本語, 大阪
- バイオDX産学共創拠点におけるデータ解析基盤技術開発, 坊農秀雅, 第67回日本応用動物昆虫学会大会, 2023年03月13日, 招待, 日本語, 大阪
- RNAシーケンスデータのメタ解析, 栂浩平, 坊農秀雅, 第67回日本応用動物昆虫学会大会, 2023年03月13日, 招待, 日本語, 大阪
- Plant & Animal Genome Conference (PAG30)
- Meta-Analysis of Public Apis Genomes and Transcriptomes, Hidemasa Bono, Kakeru Yokoi, Plant & Animal Genome Conference (PAG30), 口頭発表, 2023年1月13日, 英語, San Diego CA USA
- Genome Editing Meta-Database By Computationally Automated Knowledge Extraction from Literatures, Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono, Plant & Animal Genome Conference (PAG30), 口頭発表, 2023年1月13日, 英語, San Diego CA USA
- A Highly Contiguous Genome Assembly of Red Perilla (Perilla frutescens) Using PacBio HiFi Sequencing Data, Keita Tamura, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Shuji Matsushita, Yoshihiro Kato, Takeshi Ishikawa, Keisuke Okuhara, Yasukazu Nakamura, Hidemasa Bono, Plant & Animal Genome Conference (PAG30), ポスター発表, 2023年1月13日, 英語, San Diego CA USA
- Pitch Designer 2.0: Fully Automated Sequence Design Tool for CRISPR-Cas9-Mediated Knock-in Using Template for Short Homology-Based DSB Repair, Kazuki Nakamae, Shota Nakade, Naoaki Sakamoto, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Plant & Animal Genome Conference (PAG30), 口頭発表, 2023年1月13日, 英語, San Diego CA USA
- 第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド
- 2022
- 第45回日本分子生物学会年会
- ゲノム編集メタデータベースの構築 ~文献情報からの知識抽出~, 鈴木貴之, 坊農秀雅, 第45回日本分子生物学会年会, ポスター発表, 2022年11月30日, 日本語, 幕張
- 吉野川由来スジアオノリのナノポアシークエンシングおよびゲノムアセンブリ, 田村啓太, 坊農秀雅, 第45回日本分子生物学会年会, ポスター発表, 2022年11月30日, 日本語, 幕張
- 密度依存的な表原型可塑性を示す昆虫におけるRNAシーケンスデータのメタ解析, 栂浩平, 横井翔, 坊農秀雅, 第45回日本分子生物学会年会, 口頭発表, 2022年12月2日, 日本語, 幕張
- MaChIAto を活用したMMEJノックインとPrime Editingの正確性およびノックイン効率に影響する配列因子の探索, 中前和恭, 山本国寿, 武永充正, 中出翔太, 田頭尚美, 名塚一郎, 粟津暁紀, 坂本尚昭, 佐久間哲史, 山本卓, 第45回日本分子生物学会年会, ポスター発表, 2022年11月30日, 日本語, 幕張
- ゲノム編集のための昆虫遺伝子機能アノテーションワークフロー, 坊農秀雅, 坂本卓磨, 粕川雄也, 天竺桂弘⼦, 第45回日本分子生物学会年会, ポスター発表, 2022年11月30日, 日本語, 幕張
- ゲノム編集メタデータベースの開発 -文献からの情報抽出-, 鈴木貴之, 坊農秀雅, トーゴーの日シンポジウム2022, ポスター発表, 2022年10月05日, 日本語, オンライン
- ナノポアシークエンサー MinION による吉野川由来スジアオノリのゲノムシークエンシング, 田村啓太, 坊農秀雅, 第39回日本植物バイオテクノロジー学会（堺）大会, 口頭発表, 2022年09月13日, 日本語, 堺
- 密度に依存して表現型を変えるアブラムシ類およびバッタ類におけるRNA-seqデータのメタ解析, 栂浩平, 2022年度ROIS-DS-JOINT共同研究集会「昆虫における次世代シーケンスデータ解析および公共データベース利用」, 口頭発表, 2022年09月1日, 日本語, 柏
- 公共データベースを利用した環境ストレスに関連するゲノム編集標的遺伝子の選定, 米澤奏良, 坊農秀雅, 超異分野学会 大阪大会2022, ポスター発表, 2022年08月27日, 日本語, 大阪
- 日本ゲノム編集学会第7回大会
- ゲノム編集ターゲット遺伝子のデータベースの構築とその解析, 鈴木貴之, 坊農秀雅, 日本ゲノム編集学会第7回大会, ポスター発表, 2022年06月07日, 日本語, オンライン
- 適切なガイドRNA選択のための in silico 解析リソース, 中前和恭, 日本ゲノム編集学会第7回大会, 口頭発表, 2022年06月06日, 日本語, オンライン
- 第45回日本分子生物学会年会
- 2021
- バイオDX産学共創拠点におけるデータベース基盤技術開発, 坊農秀雅, 奥原啓輔、横井翔、中村保一, トーゴーの日シンポジウム2021, ポスター発表, 2021年10月05日, 日本語, JST バイオサイエンスデータベースセンター, オンライン
- 赤紫蘇を用いたゲノム編集データ解析基盤技術の開発, 奥原啓輔, 加藤義啓, 石川武, 馬場堅治, 松下修司, 坊農秀雅, 日本ゲノム編集学会第6回大会, ポスター発表, 2021年06月17日, 日本語, オンライン
- 2020
- ゲノム編集研究のためのデータベース基盤技術開発, 坊農秀雅, 奥原啓輔, トーゴーの日シンポジウム2020, ポスター発表, 2020年10月05日, 日本語, オンライン
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