アカシソゲノム編集論文

東広島に来て以来、広島県農業技術センターさんと三島食品さんの協力のもと、有用物質生 …

ぼうのブログ復活！

ブログの更新ができなくなってしまっていたのはコンテンツがないのではなくて、

UnserializableContentError: Control characters are not supported …

2025年出張外泊数

すっかりブログの更新ができなくなってしまっているが、これだけは記録したい。

毎年恒例の出張外泊数だが、年内 …

2025年7月を振り返って

学部講義を担当する第2タームの後半戦の7月。 基本週2回で、祝日の振替で3回授業がある週が出てきたり。 しかもその週はオムニバス講義の担当もちょうどあって、0.5コマ分ではあったが週4回 …

2025年6月を振り返って

学部の学科長仕事もちらほらある中、学部講義を担当する第2タームが始まった6月。 これまでの1,2回の担当でなく、15回でしかも週2回。 それがほぼ半分終わったところ …

2025年4月を振り返って

bonohulabを始めて、6年目に突入。 学部の学科長になってしまったため、そっち系の仕事がどんどん「降ってくる」感じで、 新入生ガイダンスやオリ …

ゲノム編集とバイオインフォマティクスの最近の進歩2025

英文総説がやっと出版。

Recent Advances in Genome Editing and Bioinformatics: Addressing Challenges in Genome Editing Implementation and Genome …

2025年3月を振り返って

無事、東広島移住丸5年も迎えた。

3日に阪大で大学院生の頃からお世話になってきた松田秀雄先生の定年記念講演に。 関東方面での打ち合わせ1回と学会年会での講演1回、と出張が復活した3月であった。 月末29日には、一般社団法人バイオDX推進機構主催の「バイオDXの世界 ゲ …

2025年2月を振り返って

初めての学部学生による卒論発表会を迎え、学務の色々は一段落。 また、学生主体によるハッカソンのBioDXthonが月末に開催された。

今月出版された原著 …

2025年1月を振り返って

今月は、去年ほどではなかったものの（年末の）航空機事故に始まり、月末もそれに終わった感じ。 さすがに学部4年生、修士 …

Apple silicon macでのFASTA36

Homebrewでうまくできないようなので、調査。 普通にソースをcloneしてきて、Makefileを指定したら問題なくビルドできる模様。

git clone https://github.com/wrpearson/fasta36
cd fasta36/src
make -f ../make/Makefile.os_x_arm64

バイナリは bin/以下にできてるのがちょっとき …

RNAseqレシピ本2のランキング　2024年

2023年10月に発売されたRNAseqレシピ本2だが、 出版元による2024年年間ランキングの生命科学・基礎医学で4位に。 やはり、出版社がウェビナーやって宣伝強化した効果が大きかったの …

2025年の計

明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。

「一年の計は元旦にあり」。今年も一年の計、「2025年の計」を。

1. 研究 …

2024年を振り返って

今年2024年はラボを主宰し始めてから5年目。 プロジェクト雇いの年更新から大学本体から雇われる定年制となって学部教育に関わるようになって2年目で …

2024年出張外泊数

毎年恒例の出張外泊数だが、年内の出張がすべて終わって数が確定、2024年は41泊となった。 2021年は11泊、2022年は22泊、昨年2023年は42泊と倍増してきた。 昨年のは2023年5月以降政府による制限がなくなり、出張 …

2024年12月を振り返って

2024年12月はまさに師走。 宿泊を伴う出張が4回もあり、招待講演が2回、国際ワークショップと共同研究打ち合わせがそれぞれ1回。 そのうち3回が関東で、合計5泊 …

The 4th International Collaborative Workshop on Functional Genomics, Molecular Biology, and Biochemistry of Insect Cuticular Extracellular Matrix

JST COI-NEXTによる昆虫のクチクラに関する国際ワークショップということで、東京農工大学府中キャンパスへ。 Opening remarkを話させていただいたほか、昆虫のゲノム解読に関してキンウ …

2024年11月を振り返って

2024年11月は、宿泊を伴う出張は第47回日本分子生物学会年会だけであったが、前泊も含めて3泊。 学務的には、学部2年生の実習に初めて参加し、それが3回連続で。

また、殺虫剤抵抗性トコジラ …

第47回日本分子生物学会年会

千葉の幕張であった一昨年、神戸ポートアイランドであった昨年に引き続き、今年も恒例の分セーに参加。 今年は …

ゲノム解読本入手

ついに「Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今」を2024年11月23日に入手した。 本来であれば週明けに職場に配送されるものを、集配を行う営業所留めの連絡 …

ゲノム解読本出版

2024年11月末発売とアナウンスされていた「Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今」が本日、2024年11月22日に発売された。

【新刊】本日発売（新刊配本）です！（I）
『Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今 -』

ゲノム解読の「過去・現在・未来」がわかる …

お隣の西条農業高校での講演

昨年も11月にアウトリーチ活動にも取り組み、2023年11月12日に特別授業＆体験型ワークショップ「分子系統樹をつくろう」を実施した。 今年は縁あって …

また別の新聞報道

今度は日本経済新聞に、殺虫剤抵抗性のスーパートコジラミのゲノム解読論文が掲載された。

トコ …

論文に出る遺伝子 デルジーン300

ゲノム解読と並行して密かに進めてきた出版計画があった。 それがこのデルジーン …

ゲノム解読本の執筆進捗曲線

2024年11月末には発売となる「Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今」がついに表紙もAmazonに公開された。

241111 坊農によるゲノム生物学の教科書「Dr.Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今」がメディカル …

ゲノム解読本の目次公開

早くも11月となり、今月末には発売となり、すでにAmazonにも出ている「Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今」の目次と序文が公開された。

ゲノム解読の …

2024年10月を振り返って

2024年10月は、宿泊を伴う出張はBioJapanとそれ以外の1回（1泊）だけでそれほど立て込んでいたわけではないが、学務関係で色々と。 まずは …

ゲノム解読本第1報

Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今を単著で書きました。 2024年11月末の第47回日本分子生物学会年会に間に合いました。 乞うご期待。

新聞報道

殺虫剤抵抗性のスーパートコジラミのゲノム解読論文が日刊工業新聞電子版に掲載された。

殺虫剤抵抗性 …

酒まつり2024

昨年に引き続き、今年も酒まつりへ行ってきた。

というのも、今回は県外から複数の友人を同時に迎えて、案 …

BioJapan2024

一昨年、昨年に引き続き、今年もBioJapanに参加、ということで3年連続。 今年も2022年12月末に認定されたひろしまバイオDXコミュニティのブースをベースに色々と新しい研究やコラボのネタ探しに。

#BioJapan 2024 …

殺虫剤抵抗性トコジラミのゲノム配列解読論文published

2年前の2022年に大学の公開講座ゲノム編集イノベーション～最先端のバイオテクノロジー～の3回シリーズの2回目ということで …

2024年9月を振り返って

今年も9月になっても8月からの暑さが継続。 彼岸が過ぎてようやく涼しくなってきたものの、エアコンなしでは夜は寝苦しい状態のまま月を終えよ …

性転換のメカニズムにせまる魚類の性腺トランスクリプトームのメタ解析論文出版

魚類の研究をされてきた研究 …

第146回日本育種学会講演会

広島大学東広島キャンパスで初開催だったらしい。 実は広島県でも初開催とか。

市民公開シンポジウムで話して …

第83回日本癌学会学術総会

福岡で開催された癌学会学術総会に参加。 かつては毎年発表もしていたのであるが、実に4年ぶり、2020年の広島での会以来の参加であっ …

令和6年度広島バイオフォーラム

広島バイオテクノロジー推進協議会主催の広島バイオフォーラムで話すのは2年ぶりの2回目だったが、オンサイトでは初めて …

2024年8月を振り返って

宿泊を伴う出張が3回と、何気に出張の多い月であった。

お盆の前の上旬は社会人大学院生のラボ訪問や博士論文中間 …

27th International Congress of Entomology

8年前に参加したICE2016以来のInternational Congress of Entomology (ICE)に参加。 元々この学会(Congress)は4年に1回で、前回は2020年にHelsinki開催だったのにコロナで2回延期されて、2022年に開催（不参加）。 2024年に日本で開催というのはその可能性が前回参加した2016年の時からあって、その時一緒に参加した年配の先生からはシ …

トリテルペンRDF論文出版

特任助教の田村さんによる植物トリテルペン生合成関連配列のRDF化の論文が、査読ずみ論文としてPlant …

パーキンソン病における酸化ストレスに応答する新規候補遺伝子の探索手法開発論文出版

D2の大学院生がfirst authorであるパーキンソン病に …

2024年7月を振り返って

7月は上旬は学部の授業担当があったり、大学院入試があったり、学術指導の講演があったりでひどく立て込んでいた。

さらに中旬には2回の宿泊を伴う出張があった。 一つは12年ぶりの岡山大学資源植物科学研究所での講演でお隣の県の岡山県倉敷市へ。 もう一 …

公共遺伝子発現データベースを用いた家畜動物トランスクリプトーム比較のメタ解析論文出版

M2の大学院生がfirst authorである公共遺伝子発 …

4年と3ヶ月

東広島に来てその月日、すなわち51ヶ月が経過した。 埼玉の医科大学にいたのがちょうどその長さであった。

つまり、その時よりも長 …

2024年6月を振り返って

あっという間の6月だった。 日本ゲノム編集学会第9回大会があったことが大きいが、それ以外にも色々とイベントが途中から入ってきたりで。

投稿していた論文は色々動きがあった …

日本ゲノム編集学会第9回大会

昨年に引き続き、オンサイトでゲノム編集学会大会。 今回は大阪中之島の大阪市中央公会堂 …

日本のキンウワバトビコバチゲノム配列解読論文

bioRxivから公開していた日本のキンウワバトビコバチゲノム配列解読論文が査読済み論文として G3 Genes|Genomes|Genetics からpublished。 東京農工大学大学院 農 …

2024年5月を振り返って

2024年5月は、なんといっても昨年末から用意してきた研究室のロゴとHexStickerができたことが一番の出来事であった。 また、教養の …

IJMSでSpecial Issueふたたび

International Journal of Molecular Sciences (IJMS)にて、Research Advances in the Bioinformatics of Genome Editing and Gene Function Analysisと題したSpecial IssueのGuest Editorをすることに。 その名の通り、ゲノム編集と遺伝子機能解析に関 …

初の同時双方向

これまで大学院講義ではオンラインだったが、オンデマンドで。 オンライン同時双方向は今回が初め …