Articles in the papers category

  5. Triterpene RDF Paper Published

    トリテルペンRDF論文出版

    特任助教の田村さんによる植物トリテルペン生合成関連配列のRDF化の論文が、査読ずみ論文としてPlant …

  6. GeneDiseaseLinker Paper Published

    パーキンソン病における酸化ストレスに応答する新規候補遺伝子の探索手法開発論文出版

    D2の大学院生がfirst authorであるパーキンソン病に …

  14. Reference genome sequences of Mythimna separata published

    アワヨトウゲノム配列解読論文

    1ヶ月前にbioRxivから公開していたアワヨトウゲノム配列解読論文が査読済みとなり、Insectsからpublished。 acceptedから1日でという爆速はいつも通り。

    Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae) https://doi.org/10.3390/insects13121172

    今年になって始 …

  24. Meta-analysis of the public RNA-Seq data of the Western honeybee Apis mellifera to construct reference transcriptome data

    セイヨウミツバチの公共RNA-Seqデータのメタ解析によるリファレンストランスクリプトームデータの構築論文

    研究員（当時）とNARO横井さんによる、セイヨウミツバチApis melliferaの公共RNA-Seqデータのメタ解析によってリファレンストランスクリプトームデータを構築し、それを利用した解析事例の論文がbioRxivから公開。

    先 …

  25. Green Alga Genome by MinION published

    MinIONによるアオノリゲノム配列解読論文出版

    はじめはMinIONで初のゲノム配列解読のテストのつもりでやっていたのだが、きっちり論文にまとめるところまでやっていただき、プロジェクト研究員によるアオノリゲノム解読 …

  29. Fanflow4Insects

    昆虫用Fanflowにいたるまで

    論文がまた一本出た。 と言っても、bonohulabからは、去年2021年12月以来、ほぼ半年ぶり。 久しぶりの自分がfirst authorの論文だった（と言っても1年4ヶ月ぶり）。 今回のテーマ …

  33. Exploratory Hypoxic Transcritome Meta-Analysis

    新しいリファレンストランスクリプトームで新しい探索的メタ解析

    D2の大学院生（社会人ドクター）による論文がbioRxivから公開された。

    Exploratory Meta-Analysis of Hypoxic Transcriptomes …

  39. Comparison of Oxidative and Hypoxic Stress Responsive Genes from Meta-Analysis of Public Transcriptomes

    トランスクリプトーム公共DBのメタ解析による酸化ストレスおよび低酸素ストレス応答遺伝子の比較論文

    ほぼ1ヶ月前に投稿と同時にbioRxivで公開した論文が査読論文誌であるBiomedicinesに出版された。 火曜日にaccepted、木曜日の夜にProofreadingが送られてきて、それを翌金曜日の午前に …

  41. A new way of training students

    新しい大学院生の育成方法

    2021年4月に入学した博士課程前期の大学院生による以下の論文がbioRxivから公開された。 今回はなぜか通常は24時間程度で終わるbioRxivのスクリーニングに時間がかかり、uploadしてから60時間目にメールが来るというのはこれまでの最長記録だったが。

    Comparison of Oxidative and Hypoxic Stress Responsive Genes from Meta-Analysis of Public Transcriptomes https://doi.org/10.1101/2021.11.01.466837

    公共DBから集めてきたヒト培養細胞の低酸素トランスクリプトームに対して先輩の大学院生が論文化し …

  47. Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing ACE2 via AHR signal published

    AHRシグナルを介したACE2の抑制によるSARS-CoV-2感染のin vitroでの抑制

    2021年3月にbioRxivにアップロードした論文、

    Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting enzyme 2, via aryl-hydrocarbon receptor signal. https://doi.org/10.1101/2021.03.04.433658

    が、査読論文誌にpublished。

    Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting enzyme 2, via …

About Me