低酸素トランスクリプトームとビブリオームの統合メタ解析論文
bioRxivで公開した論文が査読論文誌であるBiomedicinesに出版された。 前回の研究で使 …
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Comparative stick insect midgut transcriptomes paper out
ナナフシ中腸比較トランスクリプトーム論文公開
2021年5月13日、かねてより取り組んできたナナフシの中腸トランスクリプト …
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Diversification of mineralocorticoid receptor genes in a naked mole-rat
ハダカデバネズミの2つのMR遺伝子論文
Diversification of mineralocorticoid receptor genes in a subterranean rodent, the naked mole-rat.
https://doi.org/10.1530/JME-20-0325ハダカデバネズミの2つのミネラルコルチコイド受容体遺伝子論文が査読論文誌である Journal of Molecular Endocrinology に出版された。
学振 …
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A new way of life, a new way of publishing papers
新しい生活様式で新しい論文出版様式
2020年10月に入学した大学院生（社会人ドクター）による以下の論文がbioRxivから公開された。
Multi-omic meta-analysis of transcriptomes and the bibliome uncovers GPR146 as the novel hypoxia-inducible gene
https … -
Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing ACE2 via aryl-hydrocarbon receptor signal
AHRシグナルを介したACE2の抑制によるSARS-CoV-2感染のin vitroでの抑制
メンバー的には以前からの共同研究者との研究だが、広島に来てから始めた共同研究。 bioRxivにアップロードされたのが公開。
Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting …
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Meta-Analysis of Oxidative Transcriptomes in Insects
昆虫における酸化ストレス刺激のメタ解析
公共データベースからストレス刺激のtranscriptomeを集めてきてメタ解析をする研究をずっとしてきて、2020年1月に最初の査読論文を公開した(DOI:
10.3390/biomedicines8010010)。そのシリーズ第二 …
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Full-length 16S rRNA gene amplicon analysis of human gut microbiota using MinION nanopore sequencing confers species-level resolution
完全長16S rRNAをMinIONでアンプリコン配列解読
ヒト腸内細菌叢でそれを試したところ、種レベルの解像度で細菌の同定ができるという共同研究論文が …
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CSE activates HIFs in a ROS-dependent manner in human endometrium stroma cells
共同研究論文が Antioxidants 誌に出版
初出勤よりも早く、査読ずみ論文として、関西医科大学の広田さんとの共同研究論文が出 …
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Mariner-like elements in Apis
Evolutionary insights into Mariner-like elements in Apis species
着任後まもない、この4月に一度bioRxivにアップロードしてあったApis（ミツバチ属）のMariner-like elementに関する論文（プレプリント）をアップデート。 とはいえ、ほぼ全 …
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FANTOM enters 20th year
FANTOM20周年論文公開
2020年11月19日、Nucleic Acids Research のdatabase issueに FANTOM resource の論文が公開された。
FANTOM enters 20th year: expansion of transcriptomic atlases and functional annotation of non-coding RNAs
https://doi.org/10.1093/nar/gkaa1054論文の内容に関しては …
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Characterization of brown adipose tissue thermogenesis in the naked mole-rat
ハダカデバネズミの褐色脂肪論文
Characterization of brown adipose tissue thermogenesis in the naked mole-rat (Heterocephalus glaber), a heterothermic mammal
https://doi.org/10.1038/s41598-020-74929-62020年4月末にbioRxivにプレプリントとして公開されていたハダカデバネズ …
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TUATinsecta paper
TUAT insecta論文公開
2020年10月15日、TUATinsectaデータベースの論文が公開された。 昆虫とそれが食べる植物（食草）の関係をデータベース化して、そこから見つけてきたこ …
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Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping
FANTOM6論文公開
2020年7月27日、Genome Research に FANTOM6 の最初の論文が公開された。
Functional Annotation of Human Long Non-Coding RNAs via Molecular Phenotyping
https://doi.org/10.1101/gr.254219.119論文の内容に関しては理化学研 …
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TogoEx report in BH19 Europe
TogoEx report in the BioHackathon Europe 2019
昨年(2019年)の秋に参加したBiohackathon Europe 2019 での TogoExグループの報告が2020年7月13日、BioHackrXivにプレプリントとして公開された。
TogoEx: the integration of gene expression data
https://doi.org/10 … -
Senescent cell death as an aging resistance mechanism in naked mole-rat
ハダカデバネズミの老化細胞死論文
Senescent cell death as an aging resistance mechanism in naked mole-rat
https://doi.org/10.1101/2020.07.02.1559032020年7月4日、プレプリントとして公開され …
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GLIS1 Paper Published
新規低酸素応答因子GLIS1の論文published
広島大学原爆放射線医科学研究所の谷本先生、廣橋先生のグループとの共同研究論文がadvance articleとして …
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Copidosoma Polyembryony Paper Published
キンウワバトビコバチの多胚形成の論文published
去年(2019年)の3月に投稿して。 11ヶ月経ってようやくキンウワバトビコバチの多胚形成に関する論文が出版された。
Analysis of molecular mechanism for acceleration of polyembryony using gene functional annotation pipeline in Copidosoma floridanum. BMC Genomics 21:152 (2020) doi:
https://doi.org … -
AOE paper published
公共遺伝子発現DB目次AOEの論文がPLOS ONEにpublished
2019年5月のCold Spring Harbor Laboratory Meeting、The Biology of Genomesに参加、ポスター発表する前に、学会発表する前にはその内容をbioRxivにアップすると …
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Paper accepted: meta-analysis of hypoxic transcriptome
低酸素トランスクリプトームメタ解析論文が査読論文誌にaccpet
低酸素関係の研究会で始めて発表したのは、2006年にあった第3回がんと …
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Superoxide dismutase down-regulation and the oxidative stress is required to initiate pupation in Bombyx mori
蛹化が早まる現象の分子メカニズムの一端を解明
東京農工大学大学院農学研究院生物生産科学部門 天竺桂弘子准 …
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Kaiko RefEx
カイコのリファレンストランスクリプトームデータ公開
微力ながら参画させていただいたカイコリファレンスト …
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AOE paper uploaded to BioRxiv
AOEの論文をBioRxivにアップロード
All of gene expression (AOE)の論文を次週からのCold Spring Harbor Laboratory (CSHL)での学会発表（ポスター発表）を前にBioRxivにアップロードした。
All of gene expression (AOE …
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Hypoxia-inducible factors are not activated by isoflurane
共同研究論文が PLOS ONE に掲載
関西医科大学 広田 喜一 学長特命教授を中心とした研究グループによる共同研究論文 “Cancerous …
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Comparative analysis of seven types of superoxide dismutases for their ability to respond to oxidative stress in Bombyx mori
活性酸素を除去する新型酵素を昆虫から発見
東京農工大学大学院農学研究院生物生産科学部門 天竺桂弘子准教授 …
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Suppression of mitochondrial oxygen metabolism mediated by the transcription factor HIF-1 alleviates propofol-induced cell toxicity
共同研究論文がScientific Reportsに掲載
関西医科大学 広田 喜一 学長特命教授を中心とした研究グループによる共同研究論文 “Suppression of mitochondrial oxygen …
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