Articles in the misc category

  4. Symposium105 2020

    オンラインのトーゴーの日シンポジウム2020

    10月5日は、トーゴーの日。 今年でついに10回目だが、やはり今年はトーゴーの日シンポジウ …

  6. 79th JCA

    第79回日本癌学会学術総会

    今年2020年の癌学会学術総会は、広島での開催だった。 ちょうど自分が広島に異動して、いいタイミングで多くの人と再会し、またその前後 …

  7. You are (not) alone

    ぼっちラボでなくなった?

    大学院は10月入学もありまして。 生命医科学プログラム博士課程後期の社会人大学院生として入学された小野 …

  9. WSL2 for Bioinformatics

    WSL2でバイオインフォマティクス

    Windows Subsystems for Linux2(WSL2)を使って、ubuntuをインストールしたことは2ヶ月ほど前のエントリに書いた。 その際、いくつかのツールがaptの仕組みを使ってインストールできることも確 …

  16. August2020

    2020年8月を振り返って

    ひき続き予算獲得のための諸々と10月からのバイオインフォマティクスの授業準備がメインの毎日。 中旬は世間は夏休みだったが、体のメンテナンスのため有給休暇を（転職後初めて …

  19. Private trip to Tokyo

    東京往還

    通院で、約半年ぶりに東京というか関東へ。 前日の仕事終わってから飛んで宿泊という一泊二日のコース。 大 …

  21. Consecutive Losses

    連敗中

    野球の話じゃなくて、自分のこと。 なかなかにむづかしい、研究費獲得。

    もちろん現職は卓越大学院の教育が本務 …

  28. TransDecoder in Docker

    TransDecoderをDocker上で実行してみたが

    Trinityがうまくいったので、その塩基配列をアミノ酸配列に変換するTransDecoderを。 BiocontainersのTransdecoderを使わせてもらう。

    #!/bin/sh
docker run --rm -v `pwd`:`pwd` quay.io/biocontainers/transdecoder:5.5.0--pl526_2 TransDecoder.LongOrfs \
-t `pwd`/$1 …

  29. Trinity in Docker

    TrinityをDocker上で実行する

    新しいマシン環境で de novo transcriptome assembly のためにTrinityを動かす必要が出てきた。 Trinityをインストールするには多数のツールを入れる必要がある。

    まっさらな環境に一度入れるだけならそれでいいのだが、他のプログ …

  30. August 6th at Hiroshima

    広島で8月6日

    実は広島県人クオーターな私は、小さな頃からこの8月6日という日にあったことを学校教育だけでなく、親類にも刷り込まれて生きてきた。 そういうこともあ …

  31. Invasive Species Book

    侵略! 外来いきもの図鑑

    今の勤務先になって、以前よりも昆虫をはじめとする生き物に遭遇することが多くなり。 自分 …

  32. The Handbook of Cicadas

    セミハンドブック

    2020年4月からの勤務地は、梅雨の最中からヒグラシが夕方に大合唱。 セミの鳴き声を聴く機会が以前にも増して多くなっ …

  36. iconv

    iconv

    TIBCO Spotfireで出力したデータそのもののテキストファイルはそのままではlessで見るとテキストなのに文字化け。 なのにvimで開くとバッチリ見える。 それはUTF-16になっているからのようで、普通にテキストファイルと …

  38. dashidouraku

    出汁醤油道楽

    kikkomanというとアメリカでは醤油が出て来るほど、醤油はキッコーマンが一番メジャーだというのはもちろん知っているが、日本各地で地域特色を生 …

  39. Powerjc

    タワー式電源タップ

    7月になって来客が増えて来た。 その度にお客さんから「これは何？」と言われるのが、このタワー式電源タップ。

    USBポートの給電も直接できて、アダプタいらず …

  41. Return of the Marp

    Marp再び

    昨年ぐらいまではこのMarpをmarkdownエディタとして愛用してきた。 しかし、エディタ機能はディスコンということで、Visual Studio Code(VS Code)を使うようになり、現在もVS …

  42. Genome Editing Bluebacks

    ゲノム編集とはなにか

    講談社ブルーバックスから広島大学大学院統合生命科学研究科 山本卓教授による「ゲノム編 …

  43. Important is real discussion

    重要なのは対面の議論

    出張が解禁になって、訪問者が増えてきた。 その人たちとの議論がとても重要だと今更ながら …

  44. June2020

    2020年6月を振り返って

    予算獲得のためにいろいろ考えたり、書き物したりの毎日だった6月。

    リモート参加しようと思っていた今月のSPARQLthonであるSPARQLthon93 …

  45. BoYata

    ノートパソコンスタンド導入

    MacBookProでの作業はもう長い間やっているものの、長時間同じ姿勢を取ってしまいがち。 そこで自然と、体勢を変えたりして体が固まら …

  46. Fermentation mash

    仕込み

    県外から初の来客。 そういうわけで、やはり初の街のご案内。 数ヶ月前にも自分が紹介される側で来たのだが、今 …

  47. May2020

    2020年5月を振り返って

    StayHomeで家に缶詰の大型連休はかなり久しぶりではないだろうか。 その前から在宅続きのため、より長く感じたのは私だけではなかろう。

    前半は、初の担当分の大学院講義の準備。 こ …

  50. Dishwasher dryer

    食器洗い乾燥機導入

    Stay Home励行ということで、自炊が増えて、洗い物が増えた。 なかなか大変ということで、食器洗い乾燥機を検討してみよ …

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