Articles in the misc category

  2. Magcup for the paper

    論文マグカップ

    自分がcorresponding authorの、自ラボから出た論文が出始めた。 twitterでも話題になっていた論文マグカップをbonohulabでもやってみたいと思ったが、コロナ禍の状況で海外のサービスを使ってオーダー …

  3. Genome Editing for the Future

    広島大学先端科学セミナー「ゲノム編集で未来を拓く」

    「バイオインフォマティクスがどのようにゲノム編集に利用で …

  5. April2021

    2021年4月を振り返って

    先月までとは打って変わり、ラボに人が常駐するようになった。 まずは彼らとやるべき課題を一緒に考え、そしてそ …

  6. Paper submission rush

    論文投稿ラッシュ

    今週は、コラボ関係で論文が2本投稿された。 bioRxivへアップして、そして投稿という流れができつつあって、とてもいい感じ。

    そうい …

  7. bonohulab becomes non-bocchilab

    ボッチラボではなくなった

    新年度（2021年度）を迎え、bonohulabも新しいメンバーを4人も迎えることとなった。

  8. March2021

    2021年3月を振り返って

    この3月は、年度末であることと、春の学会シーズンということもあって、外部講演が3つもあった。

    1. 「データ駆動型ゲノム育種技術の …

  9. Shutoiten 1year

    酒都移転1年

    今日で酒都西条に移転して丸1年。 職種の関係上、引きこもり生活になることが予測されていたが、COVID-19の影響でより完全に出張のない新しい …

  13. Return the debt

    借りを返す

    有給休暇取得5日達成、ということで。 自覚症状あるぐらいの、大変良いリフレッシュに。 このようなリフレッシュ …

  14. TapeStation4150

    TapeStation他納品

    これで自ラボでRIN値が測定できるように。 外注でRNA-Seq出す時にサンプルのRIN値を求められることが多く、そこがメインの目的であったが、説明を聞いてみるとそれだけではない色々が。 大昔に使 …

  15. Samplingthon

    サンプリング大会

    自分は最初と最後だけだったが、現場まで2往復してバトンを渡す。 どちらかというとサンプリングリレーかもしれない …

  16. PAGS Bioinformatics Book

    独習 Pythonバイオ情報解析

    これもまた、Twitterでその出版予定を知る。 2021年3月末に出版されるらしい。 副題が「Jupyter、NumPy、pandas、Matplotlibを理解し、実装して学ぶシングルセル、RNA-Seqデータ解析」で、 出版社のこの書籍のページの説明文に曰く …

  17. February2021

    2021年2月を振り返って

    緊急事態宣言継続で引きこもりも継続だったが、大学や大学院の研究発表会の季節ということでそれを嘆く暇も …

  20. Catalina's trap

    Catalinaの罠（Java編)

    リモートからラボのmacOS Catalina(c10.15.7)なマシンにsshして計算させているときに。 なぜか、いつもはすぐに実行されるプロセスが開始しない。 おかし …

  21. January2021

    2021年1月を振り返って

    緊急事態宣言発令により、出張が全てキャンセルになってしまった。 職場のエリアには出なかったものの、出張先が …

  23. Python for Bioinformatics 2nd Eds in Japanese

    Pythonによるバイオインフォマティクス 原著第2版

    Twitterでその出版予定を知る。 2021年2月末に出版されるらしい。

  25. 1 liner of 210114

    今日のワンライナー

    今日重宝したワンライナー。

    gene1
    gene2
    gene3
    ...

    みたいなfile.txtというファイルに書き込まれた改行区切りの …

  26. 1 liner of 210106

    今日のワンライナー

    今日重宝したワンライナー。

    gene1 -2.0
    gene2 -1.5
    gene3 1
    ...

    みたいなデータから-1以下の行だけ抽出。

    % perl -anle 'print $_ if(@F[1] < -1)' DEG.txt

    Gene …

  27. Plan 2021

    2021年の計

    明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。 年頭恒例にしている「一年の計は元旦にあり」。 今年 …

  30. December2020

    2020年12月を振り返って

    書類上の出勤日は昨日28までということで、少し早めの12月の振り返りエントリ。

    先月からの流れで、（ウェットな）実験室整備を着々と進めた2020年12月であった。 特に注文していたMinIONが届いたり。

    そん …

  32. Python Interactive Data Visualization Book

    Python インタラクティブ・データビジュアライゼーション入門

    この本の作成時に査読をされた、という辻さんのtweet

  37. MinION is come

    ナノポアがやってきた

    発注してからちょうど丸1ヶ月で、MinIONが納品。

    そして約15年ぶりに、自ラボでのウェット＆ドライ復活。

  38. COI-NEXT started

    共創の場形成支援プログラム「育成型」採択

    2020年4月に東広島に来た当初からその構想を練り、準備して来た「共創の場形成支援プログラム」に広島大学が代表機関とし …

  39. The First Business Trip 2020

    2020年度初出張

    転職後初の出張で、古巣へ。 つまり、2020年度初の出張ということなのだが、去年度まで100日近い出張宿泊日数であった自分。 それからすると、激変した今年であったわけで。 COVID-19が主な原因ではあるが、転職というのも …

  42. Love your neighbor

    汝の隣人を愛せよ

    これまで足を踏み入れたことがなかった学内の研究所にお邪魔して実験機器を見せてもらい、色 …

  43. Lay the groundwork

    根回し重要

    本日、2つの講演依頼が来た。 1つはかねてより他の機会にその話を聞いていたもの、他方は今日初めて「寝耳に水」的にしかも学会事務局から事務的に来たものであった。 結果は言う …

  46. Cancer_DAT call for subject

    がんゲノムデータ解析再現担当募集

    このたびMEDSiからがんに特化したゲノム・オミックス解析の本を出すことになりました。 つきましては、再現 …

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